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Shabir Madhi es profesor de Vacunología en la Universidad de Witwatersrand, Johannesburgo, Sudáfrica; y cofundador y codirector de la Iniciativa de Liderazgo Africano para la Experiencia en Vacunología (ALIVE). Completó su formación de grado y postgrado en la Universidad de Witwatersrand, obteniendo el título de pediatra en 1996 y el doctorado en 2003.
En la actualidad, también ocupa el cargo de Director de la Unidad de Investigación de Patógenos Respiratorios y Meningeos del Consejo Sudafricano de Investigación Médica y la Cátedra de Investigación en Enfermedades Prevenibles por Vacunación del Departamento de Ciencia y Tecnología/Fundación Nacional de Investigación. Fue el último director del Instituto Nacional de Enfermedades Transmisibles (2011-2017), y actualmente preside el Grupo Consultivo Nacional sobre Inmunización en Sudáfrica.
Es coautor de más de 470 publicaciones científicas desde 1997 y ha supervisado a 23 estudiantes de doctorado. Su investigación se ha centrado en la epidemiología y el desarrollo clínico de vacunas que salvan vidas contra la neumonía y las enfermedades diarreicas. Más recientemente, se ha centrado en el desarrollo de vacunas para la inmunización de mujeres embarazadas en beneficio de ellas y de sus hijos. Sus investigaciones han sido fundamentales para desarrollar las recomendaciones de la Organización Mundial de la Salud sobre el uso de la vacuna antineumocócica conjugada, la vacuna contra el rotavirus y la vacunación contra la gripe en mujeres embarazadas. Actualmente dirige las dos primeras vacunas COVID-19 que se están llevando a cabo en el continente africano, y que se están realizando en Sudáfrica.